기저핵은 운동을 통제하는 기능을 담당. 기저핵이 손상되는 경우 신체 근육이 경직되어 몸을 제대로 움직이지 못하는 파킨슨병, 자신의 의지와 상관없이 무의미한 상동증적 움직임을 반복하는 헌틴턴병이 발병할 수 있다.
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